ScriptManager.RegisterClientScriptInclude(this.Page,typeof(Page),"abc",this.ResolveUrl("~/JScripts/GetTime.js"));

------解决方案--------------------
1.可以从跟目录开始引用啊。
<script type="text/javascript" src="/JScripts/GetTime.js"></script>
以这个'/'开始。
2.<script type="text/javascript" src=‘<%=this.ResolveUrl("~/JScripts/GetTime.js")%>’></script>
这个和2楼差不多
3.加 runat 放到服务器端用~/JScripts/GetTime.js
<script type="text/javascript" src="~/JScripts/GetTime.js" runat="server"></script>

没有测试，书上看的。请自己选择一种进行测试。