String path = this.getClass().getClassLoader().getResource("/upload").getPath();//这里是upload与你上传部分代码所在类的相对路径
File file = new File(path);

------解决方案--------------------
在上传资源这块其实在真实的项目中并没有做的这么简单，你想想你的项目如果发布到servlet容器里面去保存在servlet容器的子目录中，这样合适吗？在真实的环境中这样根本不成。
我简单的说一下我项目的实现吧。

1.配置资源保存目录
XML code

legend.resource.root = F:/.legend