String s1 = "select u.aa,u.bb,t.cc,(select h.bb from hag h where h.bb=0) dd,(select c.bb from cat c where c.tt=1) ee from uss u left join times t on u.ttt=t.ttt where 1=1";
    String s2 = "select u.aa,u.bb,t.cc,(select h.bb from hag h where h.bb=0 order by h.bb limit 0,1) dd,(select c.bb from cat c where c.tt in(1,2,3)) ee from uss u left join times t on u.ttt=t.ttt where 1=1";
    Pattern p = Pattern.compile("\\bfrom\\b([\\s\\w.=']*?)\\bwhere\\b(.*?)(?:\\blimit\\b|\\border\\b|\\)|$)");
    Matcher m = p.matcher(s1);//对s2这种类型的就鞭长莫及了
    while(m.find()){
      System.out.println(m.group(1));
      System.out.println(m.group(2));
    }

------解决方案--------------------
不如果告诉大家你为什么要获取那些内容吧

------解决方案--------------------
为什么啊？

------解决方案--------------------
这个完全没有规则，你知道from从那里结束吗？是单一的，还是复合的！

------解决方案--------------------
import java.util.regex.Matcher;
import java.util.regex.Pattern;


public class Test {

	public static void main(String[] args){
		
		
	String s1="	select u.aa,u.bb,t.cc,(select h.bb from hag h where h.bb=0) dd,(select c.bb from cat c where c.tt=1) ee from uss u left join times t on u.ttt=t.ttt where 1=1";
	
	Matcher m=Pattern.compile("(?im)\\bfrom\\b([^(]*?)where\\b(([^()]*?(\\([^()]*?\\)[^()]*?)|([^()]*?))*?)(\\)|$|(\\border)|(\\blimit)|(\\bgroup))").matcher(s1);
	while(m.find()){
		
	System.out.println("from部分  "+m.group(1)+" where 部分 "+m.group(2));
	}
	
	System.out.println("－－－－－－－－－－－我是分割线－－－－－－－－－－－－");
	String s2="select u.aa,u.bb,t.cc,(select h.bb from hag h where h.bb=0 order by h.bb limit 0,1) dd,(select c.bb from cat c where c.tt in(1,2,3) and c.yy in('33','44')) ee from uss u left join times t on u.ttt=t.ttt where 1=1";
	
	 m=Pattern.compile("(?im)\\bfrom\\b([^(]*?)where\\b(([^()]*?(\\([^()]*?\\)[^()]*?)|([^()]*?))*?)(\\)|$|(\\border)|(\\blimit)|(\\bgroup))").matcher(s2);
	while(m.find()){
		
	System.out.println("from部分  "+m.group(1)+" where 部分 "+m.group(2));
	}

	}
}


输出
from部分   hag h  where 部分  h.bb=0
from部分   cat c  where 部分  c.tt=1
from部分   uss u left join times t on u.ttt=t.ttt  where 部分  1=1
－－－－－－－－－－－我是分割线－－－－－－－－－－－－
from部分   hag h  where 部分  h.bb=0  
from部分   cat c  where 部分  c.tt in(1,2,3) and c.yy in('33','44')