现在市场上的电子商务软件基本上可归结为两大阵营，即PHP阵营和JAVA/JSP阵营。但对接触电子商务不久的用户来说，看到的往往只是它们的表相，只是明显的价格差异，却很难看出它们之间的实际差异。

?????? 1、系统的技术架构比较
分层是将系统进行有效组织的方式，分而治之的思想是计算机领域中非常重要的思想。在好的分层思想引导下，便能实现“高内聚、低耦合”，也能将具体的问题 割裂开来，易于控制、易于延展，更易于分配资源。PHP只能实现简单的分布式两层或三层的架构，而JAVA在这方面就十分强大，可以实现多层的网络架构。运用MVC的设计模式，可使电子商务软件具有更加高效、合理的系统架构。技术架构的落后，使运用PHP编写的电子商务软件先天不足，而后天又无法补足其先天上的劣势。使得系统在可拓展性、需求应变性上与JAVA编写的电子商务软件系统的差距越来越大。架构的差距，注定了PHP做的电子商务充其量是个小家碧玉，始终无法 和JAVA这种大家闺秀同台竞技。
????? 2、数据库访问比较
PHP可编译成具有与许多数据库相连接的函数。将自己编写外围的函数去间接存取数据库。通过这样的途径当更换使用的数据库时，可以轻松地修改编码以适应这样的变化。但PHP提供的数据库接口支持彼此不统一，比如对Oracle,MySQL,SQL2000的接口，彼此都不一样。由于PHP对于不同的数据库采用不同的数据库访问接口，所以数据库访问代码的通用性不强。而JAVA通过JDBC来访问数据库，通过不同的数据库厂商提供的数据库驱动方便地访问数据库，访问数据库的接口比较统一。如果同样是将开发的web应用从MYSQL数据数转到ORACLE数据，PHP需要做大量的修改工作，而且比较繁琐。但JAVA开发的便只需要很少的更改便能实现。数据库访问方式的差异，奠定了PHP开发出的电子商务软件和JAVA开发出来的电子商务软件是马车和火车的差距，前者只能亦步亦趋而且额度有限，后者却是工业化的结晶，不仅能够包容万物而且速度上稳步提升。
????? 3、安全性对比
在JAVA的面前，PHP丢掉了很多的优势。在代码的安全性上尤为突出。PHP的开发程序在别人拿到代码后，可以很容易的进行修改。而JAVA开发的程序由于无法看到完整的源代码，只能看到一些编译好的类文件.class，所以安全性较高。加之系统架构的优势，在安全性上PHP和JAVA是相去甚远。如果非要将PHP和JAVA在安全性上做个比较的话，同一个小偷光顾PHP那是随便拿来随便改，想拿什么拿什么，拿的高兴还能大笔一辉某某到此一游。而光顾JAVA的时候，便会发现警察把守，内设自动报警装置，即便突破重重阻扰后进入居室。那值钱的东西都放在加密后的保险柜中，只能望洋兴叹、铩羽而归。
????? 4、前瞻性和拓展性
从整体来说，PHP适用于中小型系统，而JAVA适用于大型系统。PHP能够将单一的事件做好，但却不适合完成集成度较高的多项并发事件。为什么说PHP适合中小型系统而不适合做大系统呢？
首先，PHP缺乏多层结构支持。而对于大型的系统负荷站点，只能采用分布计算。将数据库、应用逻辑层和表示逻辑层彼此分开，并将同层的根据流量分开，组成二维数组。而PHP恰恰缺乏这种支持。
其次，PHP提供的数据库接口不统一，要将多个不同的数据库数据统一需要花费很大的力气。而JAVA则没有这种缺陷，可通过SUN JAVA的JAVA Class和EJB获得规模支持，通过EJB/CORBA以及众多厂商的Application Server获得结构支持。如ProBIZ的Merchant one电子商务软件产品系列。
如果将PHP比作将才，具备独挡一方的能力。那么JAVA便是帅才，具有较好的前瞻性和拓展性，整体布局和协同能力强。能够指挥千军万马，最后逐鹿中原。
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?????? 现在国内比较常见的php网店系统有shopex、ecshop；比较常见的java网店系统有shop++、全网、javashop