string temp_str = "111,222,333,111,444,222";
                temp_str = string.Join(",", Regex.Split(temp_str, @"[，,]").Distinct());//111,222,333,444

------解决方案--------------------
我自己刚才试验了一下可以用JS去除的，现在附上代码你看下

  <script type="text/javascript" language="javascript">
       $(document).ready(
           function() {
               $('#txt_test').keyup(
                   function() {
                       var txt = $('#txt_test').val();
                       var str = new Array();
                       str = txt.split(",");
                       var strc = txt.substring(txt.lastIndexOf(',') + 1, txt.length);
                       for (var i = 0; i < str.length - 1; i++) {
                           if (str[i] == strc) {
                               alert(strc);
                               var txt1 = txt.replace(txt.substring(txt.lastIndexOf(','), txt.length), "");
                               $('#txt_test').val(txt1);
                               break;
                           }
                       }
                   }
               )
           }
       )
   </script>

这个是控件
 <asp:TextBox ID="txt_test" runat="server" TextMode="MultiLine"></asp:TextBox>


这样写唯一有点不好的地方是
  如果111,
222,
111

这样排列中间有回车的话，需要对第一行单独判断一下，最后是能够写一段处理回车，空格之类的JS在这个方法里面，  这个你应该可以写出来的，  可以试试